Sebanyak 4 program studi di FMIPA UNY memperoleh akreditasi unggul dari Lembaga Akreditasi Mandiri Kependidikan (LAMDIK). Prodi tersebut adalah S1 Pendidikan IPA, S1 Pendidikan Biologi, S2 Pendidikan Kimia, S2 Pendidikan Fisika. Akreditasi berlaku dari 2025-2030. 
Dekan FMIPA, Prof. Dr. Dadan Rosana, M.Si., mengatakan ini adalah hasil kerja keras dari Prodi maupun Fakultas yang telah mempersiapkan borang akreditasi.  Tahun  ini FMIPA UNY ada 11 Prodi yang melakukan re-akreditasi dan ada 4 yang sudah keluar hasilnya dari LAMDIK yaitu terakredirasi unggul. 

Sebanyak 22 dosen Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) Universitas Negeri Yogyakarta (UNY) berhasil meraih dana hibah penelitian dan pengabdian kepada masyarakat (PkM) dari Kementerian Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan Teknologi (Kemendikbudristek) Tahun 2025.

Dalam upaya meningkatkan kapasitas kepemimpinan dan keterampilan manajerial mahasiswa, Badan Eksekutif Mahasiswa (BEM) Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Negeri Yogyakarta (FMIPA UNY) menyelenggarakan Latihan Keterampilan Manajemen Mahasiswa Tingkat Dasar (LKMM-TD).

Suasana akademik di Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) Universitas Negeri Yogyakarta terasa berbeda pada hari Kamis-Jumat (15-16/05/2025) ketika Program Studi S-1 Statistika menerima kunjungan dari tim asesor Lembaga Akreditasi Mandiri Sains Alam dan Ilmu Formal (LAMSAMA) untuk melaksanakan Asesmen Lapangan (AL).